2013年，商洛市农业局认真落实全市丹江等流域污染防治工作三年行动计划安排部署，突出重点，防治结合，推动了农业环境保护工作深入开展。 
  一是农业环境保护深入人心。健全了农业环境保护工作领导机构，逐级签订目标责任书，落实了县区和各部门工作责任。大力开展第二十一届“科技之春”宣传月、节能低碳日等活动，农村能源建设、畜禽养殖粪便治理、农作物秸秆综合利用、配方施肥等农业环境保护工作深入人心。 
  二是生态农业技术全面普及。大力推广低毒低残留高效生物农药，稳步推广有机肥，减少化肥使用量，实现节本增效。全市推广测土配方施肥技术280.1万亩，配方肥应用130.1万亩、6.5万吨。积极推广农作物秸秆综合利用技术，杜绝农作物秸秆田间焚烧行为，大力推广农作物病虫害综合防治技术。全年粮食作物防治454.1万亩次，挽回粮食损失5.85万吨，挽回经济作物产值8500万元，病虫草鼠危害损失控制在3%以下。建立千亩直接粉碎还田基地两个，示范还田2000亩，辐射群众机械还田2000亩。 
  三是畜禽粪便综合利用水平进一步提升。狠抓规模养殖场规划、建设、管理、引种、防疫、消毒、销售、排污治理等关键环节，大力推进标准化示范创建，新创建标准化示范场100个，累计达到318个，全市规模以上养殖场均建成了畜禽粪便消纳设施，粪污无害化处理能力进一步提高。新建成户用沼气5869口，在丹江流域规模养殖场新建养殖小区沼气35个。 
  四是绿色农业加快发展。全市无公害农产品开发面积达到323.7万亩，完成绿色食品基地开发面积5.58万亩，无公害农产品生产总量达到82.1万吨，产值达到29.3亿元。新认定无公害农产品产地14个，认证无公害农产品4个。无公害农产品生产已经覆盖了全市所有乡镇和85%的村。 
  五是农业生产安全执法能力明显提高。组织开展高毒农药大排查活动。全市出动执法人员253人次，印发农药安全使用知识宣传资料6550份，张贴农业部禁限用高毒农药名单220张，开展技术培训7场次。异地封存或收缴甲拌磷48.3公斤、磷化铝21.7公斤、百草枯99.6公斤、氧化乐果25.16公斤。加强农产品质量安全专项整治，全市共出动检测人员14528人次，监测场所5808个次，抽样数量30254个，涉及蔬菜、水果、食用菌、茶叶、大肉等五大类60多个品种，合格数量30238个，合格率达到99.94%，比2012年提高0.04个百分点。全市无一起农产品质量安全事故发生。 
  2014年，商洛市农业局将认真贯彻全市丹江等流域污染防治三年行动计划工作部署，大力推进农业节能减排，加强农业面源污染防治，大力推广有机肥，推进规模养殖场标准化建设和畜禽粪便资源化利用，稳步发展太阳能等新型能源，新建联户沼气20个，推广太阳能热水器3000台。深入开展农业环境保护执法，完善主体责任，加强环节监管，依法推进农业环境保护工作开展。